O Externato São José possui 23 mil metros quadrados, dos quais a metade é de área construída e a outra metade é área livre, dividida em pátios e jardins para a recreação dos alunos e o contato direto com a natureza. A escola conta com um Complexo Poliesportivo, Biblioteca, Laboratórios de Informática, Laboratório de Ciências, Sala de Artes, Sala de Dança, Salas de Audiovisual e um Salão para apresentações artísticas e culturais.